32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3188 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  65.53 
 
 
215 aa  295  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  54.5 
 
 
223 aa  238  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  47 
 
 
212 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  46.5 
 
 
212 aa  191  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  45.5 
 
 
215 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  45.5 
 
 
215 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  45.5 
 
 
215 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  46.5 
 
 
212 aa  191  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  45.5 
 
 
215 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
212 aa  191  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  46.5 
 
 
212 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
215 aa  188  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  43 
 
 
212 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  44.66 
 
 
216 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  44.39 
 
 
215 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  42.08 
 
 
213 aa  175  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  42.65 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  30 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  29.83 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
216 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  29.28 
 
 
210 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
216 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
216 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  31.15 
 
 
225 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
214 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  30.81 
 
 
223 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  29.73 
 
 
223 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  19.9 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>