More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3067 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  100 
 
 		 369 aa  775    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 1106 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2788  hypothetical protein  34.71 
 
 		 310 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00705384  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  33.13 
 
 		 254 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2639  hypothetical protein  33.91 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 810 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 208 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0609  methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 634 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 885 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  32.53 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  27.22 
 
 		 258 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  22.84 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0931  hypothetical protein  31.93 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  31.97 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  31.71 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  26.95 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.4 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  31.67 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 207 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  28.99 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  27.52 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  27.16 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 1032 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.25 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5458  Methyltransferase type 12  29.76 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  29.07 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  32.41 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  31.85 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.85 
 
 		 258 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1124 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  35.19 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.11 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.49 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  31.65 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.42 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.05 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  29.77 
 
 		 2112 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 266 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 207 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.74 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.48 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 276 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 1312 aa  56.6  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.06 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  32.14 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  30.56 
 
 		 238 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 198 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.4 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 207 aa  56.2  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 240 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 198 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  31.82 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  31.71 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.19 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.66 
 
 		 494 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>