More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3027 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  56.12 
 
 		 748 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  55.11 
 
 		 747 aa  754    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  56.66 
 
 		 745 aa  765    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  64.36 
 
 		 714 aa  857    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  61.23 
 
 		 744 aa  864    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  60.97 
 
 		 758 aa  872    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  57.72 
 
 		 785 aa  825    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  61.54 
 
 		 741 aa  871    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  55.5 
 
 		 754 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  61.47 
 
 		 738 aa  868    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  62.12 
 
 		 741 aa  875    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  60.62 
 
 		 733 aa  847    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  60.74 
 
 		 746 aa  856    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  55.36 
 
 		 767 aa  777    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  61.21 
 
 		 746 aa  871    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  61.6 
 
 		 734 aa  837    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  49.54 
 
 		 715 aa  641    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  59.92 
 
 		 733 aa  846    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 754 aa  1511    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  61.95 
 
 		 760 aa  890    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  60.61 
 
 		 762 aa  870    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  60.98 
 
 		 744 aa  844    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  50.59 
 
 		 734 aa  693    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  61.5 
 
 		 736 aa  877    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  56.72 
 
 		 753 aa  758    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  61.87 
 
 		 747 aa  877    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  54.62 
 
 		 739 aa  753    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  56.14 
 
 		 743 aa  774    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  60.61 
 
 		 762 aa  869    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  50.67 
 
 		 719 aa  682    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  59.87 
 
 		 759 aa  862    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  53.6 
 
 		 709 aa  737    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  71.58 
 
 		 751 aa  1016    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  61 
 
 		 723 aa  860    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  62.04 
 
 		 747 aa  868    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  47.21 
 
 		 739 aa  638    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  56.9 
 
 		 748 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 650 aa  592  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  59.35 
 
 		 691 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  70.6 
 
 		 758 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  69.6 
 
 		 747 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  70.33 
 
 		 737 aa  558  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.99 
 
 		 803 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  55.53 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  55.53 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 		 614 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.69 
 
 		 639 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  45.9 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  45.39 
 
 		 769 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  44.72 
 
 		 769 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 691 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  44.72 
 
 		 769 aa  378  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.8 
 
 		 770 aa  374  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  45.05 
 
 		 783 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  40.35 
 
 		 774 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  46.97 
 
 		 785 aa  369  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 770 aa  366  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 687 aa  365  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 713 aa  363  8e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 		 681 aa  363  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 697 aa  360  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 694 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.12 
 
 		 784 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 635 aa  354  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 724 aa  354  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  33.38 
 
 		 704 aa  354  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.97 
 
 		 677 aa  352  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 701 aa  350  6e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  46.43 
 
 		 610 aa  349  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 607 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 724 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 696 aa  344  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  32.45 
 
 		 681 aa  344  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 696 aa  343  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 598 aa  342  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  42.75 
 
 		 801 aa  341  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 728 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  43.48 
 
 		 601 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 673 aa  338  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 697 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 666 aa  336  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 604 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 603 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 673 aa  335  3e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  43.91 
 
 		 707 aa  334  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 1031 aa  333  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 660 aa  333  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 694 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 708 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 671 aa  332  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 919 aa  332  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  43.79 
 
 		 766 aa  331  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  43.09 
 
 		 685 aa  331  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 652 aa  331  4e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 558 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  33.29 
 
 		 715 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 919 aa  330  7e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 920 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  34.44 
 
 		 783 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 606 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>