299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2961 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  75.69 
 
 		 218 aa  357  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  74.77 
 
 		 218 aa  344  6e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  69.27 
 
 		 219 aa  331  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  70.32 
 
 		 221 aa  325  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  64.22 
 
 		 221 aa  311  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  61.29 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  60 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  53.02 
 
 		 221 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  51.63 
 
 		 217 aa  249  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  44.04 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  46.54 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  46.54 
 
 		 232 aa  204  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  46.54 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  46.33 
 
 		 236 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  45.62 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  46.4 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  45.62 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  45.62 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  45.16 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  43.52 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  44.44 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  41.33 
 
 		 228 aa  187  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  42.23 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  41.86 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  42.41 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  42.41 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  41.52 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  41.15 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  41.52 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  41.15 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  41.52 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  41.52 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  39.21 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  40.97 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  42.86 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  38.94 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  40.54 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  38.94 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  41.96 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  38.94 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  38.5 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  42.99 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  38.77 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  39.82 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  40.62 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  39.73 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  39.21 
 
 		 227 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  41.07 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  41.07 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  38.94 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  40.99 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  41.33 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  38.86 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  39.91 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  37.5 
 
 		 224 aa  161  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  40.09 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  40.18 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  38.94 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  37.17 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  36.73 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  38.94 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  38.39 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  41.31 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  39.82 
 
 		 246 aa  158  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  38.22 
 
 		 223 aa  157  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  36.4 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  39.23 
 
 		 484 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  37.78 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  37.39 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  39.82 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  40.64 
 
 		 251 aa  155  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  39.73 
 
 		 243 aa  155  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  38.84 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  39.04 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  36.32 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  35.71 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  38.05 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  37.95 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  37.33 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  37.33 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  37.33 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  37.84 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  37.83 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  36.61 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  37.89 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  39.27 
 
 		 236 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  36.36 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  38.12 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  37.55 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  37.95 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  37.55 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  37.17 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  37.73 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  37.55 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  34.68 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  37.67 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  39.64 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  37.56 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>