More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2917 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 335 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 		 363 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  29.43 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  27.57 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  28.32 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  28.11 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  30.07 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  28.9 
 
 		 358 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  27.17 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  26.92 
 
 		 343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  28.33 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  26.63 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  27.33 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  26.53 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  26.49 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  26.35 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  26.33 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  27.04 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  27.38 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  26.28 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  26.28 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  26.28 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  27.02 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  27.05 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  26.17 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  29.13 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  29.17 
 
 		 444 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  28.75 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  28.19 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  28.06 
 
 		 383 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  32.03 
 
 		 377 aa  92.8  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  32.84 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  26.15 
 
 		 395 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  25.78 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  31.97 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  24.5 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  31.97 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  28.9 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  32.58 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  34.48 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  26.18 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  25.75 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  25.75 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  25.75 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  25.75 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  31.03 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  28.76 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  25.57 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  25.57 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  25.57 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  25.57 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  25.57 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  28.07 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  28.31 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  28.07 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  28.31 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  25.57 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  31.21 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  30.57 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  28.85 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  32.08 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  30.87 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  28.76 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  26.9 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  28.76 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  32.03 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  28.76 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  32.3 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  26.15 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  24.68 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  24.68 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  32.68 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  24.68 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  24.68 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  33.97 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  24.68 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  24.68 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  24.68 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  24.68 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  28.76 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.89 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 488 aa  62.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  30.26 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.28 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  25.44 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  22.51 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  30.13 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  30.13 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  27.22 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  30.13 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  30.72 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  31.61 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.13 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>