238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2911 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  614  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  54.24 
 
 		 304 aa  351  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  55.59 
 
 		 295 aa  348  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  54.58 
 
 		 301 aa  345  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  53.56 
 
 		 301 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  53.4 
 
 		 302 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  53.4 
 
 		 302 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  53.4 
 
 		 302 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  51.7 
 
 		 297 aa  329  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  51.36 
 
 		 297 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  51.36 
 
 		 297 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  51.36 
 
 		 297 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  51.36 
 
 		 297 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  51.36 
 
 		 297 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  51.02 
 
 		 297 aa  324  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  51.18 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  52.56 
 
 		 297 aa  322  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.68 
 
 		 297 aa  322  4e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.34 
 
 		 297 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  52.86 
 
 		 301 aa  321  8e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  50.85 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  50.17 
 
 		 297 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  50.51 
 
 		 297 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  50.17 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  50.17 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  48.46 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  48.16 
 
 		 301 aa  309  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  48.44 
 
 		 294 aa  308  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  46.82 
 
 		 304 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 		 301 aa  301  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  46.15 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  47.49 
 
 		 307 aa  295  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  50.34 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  49.49 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  49.49 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  48.36 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  49.83 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  47.16 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  48 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  43.24 
 
 		 300 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  43.62 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.73 
 
 		 301 aa  265  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  46.26 
 
 		 296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  43.92 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  42.76 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  42.76 
 
 		 300 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  40.85 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  40.85 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  41.5 
 
 		 306 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  42.11 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  39.14 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  42.76 
 
 		 298 aa  231  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  39.41 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  40.13 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.82 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  40.33 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  41.81 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  41.11 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  41.75 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  39.62 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.43 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  40.86 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  40.2 
 
 		 499 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  40.2 
 
 		 499 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  40.2 
 
 		 499 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  39.53 
 
 		 499 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  45.82 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  39.06 
 
 		 464 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  39.56 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  40.48 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  38.1 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  39.29 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  37.87 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  38.49 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.05 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 		 501 aa  215  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  37.83 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  40.8 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  39.8 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  39.74 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  39.68 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  39.53 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  37.92 
 
 		 299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  37.88 
 
 		 289 aa  212  7e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  39.54 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  39.46 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  38.22 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  41.22 
 
 		 478 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  38.54 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.72 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  39.2 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  38.67 
 
 		 298 aa  208  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  39.22 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  39.2 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>