More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2882 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 371 aa  758    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  66.67 
 
 		 359 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  54.94 
 
 		 356 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  54.36 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  54.36 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  54.36 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  54.07 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  53.78 
 
 		 356 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  53.78 
 
 		 356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  53.49 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  53.78 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  51.38 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  51.69 
 
 		 382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  51.69 
 
 		 382 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  51.69 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  53.31 
 
 		 353 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  52.31 
 
 		 359 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  52.31 
 
 		 359 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  52.31 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  52.31 
 
 		 359 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  50.85 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  52.02 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  51.13 
 
 		 346 aa  349  6e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  51.42 
 
 		 356 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 		 357 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  50.7 
 
 		 346 aa  345  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  51.62 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 		 346 aa  342  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  47.04 
 
 		 356 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  47.92 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  48 
 
 		 346 aa  323  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  46.41 
 
 		 368 aa  309  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  45.53 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  45.43 
 
 		 399 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  45.14 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  45.43 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  46.04 
 
 		 406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  46.04 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  45.75 
 
 		 396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  46.33 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  44.63 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  45.54 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  44.32 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  43.27 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  44.19 
 
 		 352 aa  276  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  42.49 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  45.23 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  40.74 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  40.74 
 
 		 365 aa  257  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 		 351 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  38.74 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  38.86 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  45.36 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  39.78 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  39.44 
 
 		 348 aa  237  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  34.35 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.52 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  36.39 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  36.09 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  35.1 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  31.8 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 351 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 		 370 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  31.87 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 		 358 aa  169  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  32.97 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 		 363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  31.98 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.93 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  31.76 
 
 		 357 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  34.6 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  34.85 
 
 		 363 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  33.22 
 
 		 350 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 		 357 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  30.9 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.17 
 
 		 358 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  29.32 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  32.91 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 		 368 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 		 358 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  35.84 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  34.62 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  32.2 
 
 		 374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>