200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2861 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
695 aa  1447    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  36.33 
 
 
757 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  34.57 
 
 
749 aa  359  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  33.82 
 
 
760 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  34.42 
 
 
765 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  33.23 
 
 
779 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  35.78 
 
 
799 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  36.41 
 
 
770 aa  342  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  35.94 
 
 
771 aa  341  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  33.66 
 
 
765 aa  339  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  35.22 
 
 
772 aa  338  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  34.73 
 
 
772 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  34.73 
 
 
772 aa  333  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  34.73 
 
 
772 aa  333  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  34.92 
 
 
772 aa  333  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  34.55 
 
 
772 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  34.55 
 
 
772 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  34.55 
 
 
772 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  35.1 
 
 
772 aa  331  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  34.53 
 
 
772 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  34.59 
 
 
795 aa  330  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  34.97 
 
 
772 aa  330  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  34.92 
 
 
772 aa  330  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  34.92 
 
 
772 aa  329  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  34.92 
 
 
772 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  34.34 
 
 
794 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  34.92 
 
 
772 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  32.37 
 
 
764 aa  324  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  35.25 
 
 
804 aa  324  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  34.32 
 
 
780 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  32.71 
 
 
823 aa  323  7e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  32.21 
 
 
764 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  31.83 
 
 
763 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  33.94 
 
 
760 aa  320  6e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  33.5 
 
 
775 aa  320  6e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  34.84 
 
 
777 aa  316  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  33.06 
 
 
780 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  34.42 
 
 
775 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  33.96 
 
 
775 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  33.82 
 
 
681 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  33.52 
 
 
774 aa  306  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  32.91 
 
 
760 aa  303  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  35.06 
 
 
763 aa  301  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  33.82 
 
 
766 aa  300  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  31.14 
 
 
778 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  28.97 
 
 
752 aa  291  3e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  31.79 
 
 
712 aa  276  9e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  32.62 
 
 
836 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 
784 aa  267  5e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  28.02 
 
 
755 aa  261  2e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.08 
 
 
801 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.01 
 
 
770 aa  260  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  30.59 
 
 
768 aa  246  8e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  29.73 
 
 
779 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.79 
 
 
797 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  28.09 
 
 
776 aa  233  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  27.23 
 
 
828 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  29.86 
 
 
792 aa  233  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  30.05 
 
 
783 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  29.75 
 
 
779 aa  231  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.04 
 
 
794 aa  228  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  28.68 
 
 
746 aa  228  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  29.11 
 
 
785 aa  227  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.65 
 
 
821 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  28.02 
 
 
1024 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  28.96 
 
 
779 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 
799 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.71 
 
 
752 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  26.6 
 
 
777 aa  217  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.06 
 
 
803 aa  213  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.14 
 
 
788 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  28.45 
 
 
791 aa  208  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  28.5 
 
 
790 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  28.27 
 
 
791 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  25.47 
 
 
668 aa  204  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  28.27 
 
 
789 aa  204  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  29.23 
 
 
784 aa  204  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.65 
 
 
788 aa  204  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  27.42 
 
 
825 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  26.86 
 
 
679 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  26.86 
 
 
679 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  26.86 
 
 
679 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  25.89 
 
 
661 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  26.71 
 
 
679 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  26.71 
 
 
679 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  29.8 
 
 
608 aa  202  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.21 
 
 
787 aa  202  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.3 
 
 
788 aa  201  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.29 
 
 
799 aa  200  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  30.85 
 
 
840 aa  200  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  30.4 
 
 
695 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.01 
 
 
791 aa  197  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  26.47 
 
 
679 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  25.13 
 
 
791 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 
795 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  27.08 
 
 
795 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  27.71 
 
 
806 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  28.13 
 
 
816 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  25.97 
 
 
743 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 
806 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>