81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2721 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2721  addiction module antitoxin  100 
 
 		 62 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284593  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0555  toxin  66.67 
 
 		 86 aa  88.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273353  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1307  addiction module toxin, Txe/YoeB  68.33 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3815  hypothetical protein  76 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1207  addiction module toxin, Txe/YoeB  62.07 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.927774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5408  addiction module antitoxin  66.67 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1401  addiction module antitoxin  68 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4878  addiction module antitoxin  64.71 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3488  addiction module toxin, Txe/YoeB  64.71 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0115937  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4766  addiction module antitoxin  62.75 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0843  addiction module toxin, Txe/YoeB  62.75 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2447  addiction module antitoxin  69.39 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4635  addiction module toxin, Txe/YoeB  53.85 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242001  normal  0.279946 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1640  addiction module toxin, Txe/YoeB family  60.32 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0526904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2308  toxin YoeB  60.32 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.528458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1215  toxin YoeB  60.32 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5486  addiction module toxin, Txe/YoeB  54.1 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.617612 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5886  addiction module antitoxin  54.1 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2155  addiction module toxin component YoeB  58.73 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13394  hypothetical protein  49.18 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0756561 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  54.9 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2859  addiction module toxin, Txe/YoeB family  53.12 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0793  addiction module antitoxin  56.86 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1844  hypothetical protein  51.61 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.891967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0662  hypothetical protein  54 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0703  addiction module toxin, Txe/YoeB family  56 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.564313  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4433  addiction module antitoxin  56.86 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.322385  normal  0.385628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0312  addiction module antitoxin  54 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1700  addiction module antitoxin  54.9 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0412  addiction module toxin, Txe/YoeB family  57.14 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2026  addiction module toxin, Txe/YoeB family  46.67 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150799  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0575  addiction module toxin, Txe/YoeB family  57.14 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0391  addiction module toxin, Txe/YoeB family  59.18 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2091  RelE  54.17 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.347779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2479  addiction module antitoxin  52 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3904  addiction module antitoxin  52.94 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256744  normal  0.0837513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0988  addiction module antitoxin  50 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2088  addiction module toxin, Txe/YoeB  50 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000111653  unclonable  0.0000000950728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0027  addiction module toxin, Txe/YoeB  55.56 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0189649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3569  addiction module toxin, Txe/YoeB family  52.94 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2537  addiction module toxin, Txe/YoeB family  52.94 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3299  addiction module toxin Txe/YoeB family  54.55 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16290  addiction module toxin, Txe/YoeB family  52.94 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3893  addiction module toxin, Txe/YoeB family  58 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0246  addiction module toxin, Txe/YoeB family  52 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2008  hypothetical protein  58 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0280496  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1069  addiction module antitoxin  59.18 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0150746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4022  addiction module antitoxin  44.44 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2939  hypothetical protein  48.28 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1753  addiction module antitoxin  48.15 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.709667  normal  0.0794356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1662  addiction module toxin, Txe/YoeB family  51.92 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0202081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2532  addiction module toxin, Txe/YoeB family  50 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2536  addiction module toxin, Txe/YoeB family  48.08 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1926  addiction module toxin, Txe/YoeB family  50 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2556  addiction module toxin, Txe/YoeB  63.64 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16050  toxin-antitoxin system, toxin component, Txe/YoeB family  53.85 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1940  addiction module toxin, Txe/YoeB family  52 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0432  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3884  addiction module toxin, Txe/YoeB family  50 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1523  addiction module toxin, Txe/YoeB family  42.86 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.370643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2294  addiction module toxin, Txe/YoeB family  48 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0193925 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2431  Txe/YoeB family addiction module toxin  51.02 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0737  hypothetical protein  50.98 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000370913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2605  addiction module toxin, Txe/YoeB family  48.98 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.564887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0392  hypothetical protein  51.06 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0040336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2038  addiction module antitoxin  47.06 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2599  addiction module toxin, Txe/YoeB family  48.98 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01340  toxin-antitoxin system, toxin component, Txe/YoeB family  44.9 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4121  hypothetical protein  50.94 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0336  hypothetical protein  46.94 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.689811  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0408  addiction module antitoxin  44.9 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1840  hypothetical protein  43.14 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.185437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0231  addiction module antitoxin  41.94 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4647  addiction module toxin, Txe/YoeB family  44.9 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00453645  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2573  addiction module toxin, Txe/YoeB family  47.73 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000405967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1930  addiction module toxin, Txe/YoeB  45.65 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2586  addiction module toxin, Txe/YoeB family  45.65 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1100  addiction module toxin, Txe/YoeB  41.67 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1443  addiction module toxin, Txe/YoeB family  51.28 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.403552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1659  addiction module toxin Txe/YoeB  54.55 
 
 		 36 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0726  addiction module toxin, Txe/YoeB family  52.63 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>