More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2664 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 662 aa  1367    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1016 aa  336  9e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 873 aa  323  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.41 
 
 		 572 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02504  Signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 667 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 785 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 1229 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 		 633 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 		 781 aa  297  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1452 aa  296  9e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 631 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 944 aa  294  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 		 959 aa  294  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 973 aa  293  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.79 
 
 		 982 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 		 1127 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  40.05 
 
 		 968 aa  291  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  33.71 
 
 		 1179 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 896 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1195 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 765 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 916 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 643 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 		 846 aa  286  7e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.7 
 
 		 645 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 869 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 969 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 1199 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1788 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 1287 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 643 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 643 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  39.75 
 
 		 641 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 		 817 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 643 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  39.29 
 
 		 1560 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 		 945 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 1222 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 862 aa  280  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 731 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 		 874 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 		 606 aa  280  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 1059 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.75 
 
 		 651 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  38.5 
 
 		 651 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 863 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 865 aa  277  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  39.8 
 
 		 786 aa  277  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.93 
 
 		 620 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.12 
 
 		 631 aa  277  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.1 
 
 		 1023 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 846 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1075 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  37 
 
 		 763 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 1226 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 902 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.86 
 
 		 738 aa  275  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  37.62 
 
 		 666 aa  275  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 1324 aa  274  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 1236 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1172 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  39.43 
 
 		 578 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 1029 aa  273  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 882 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 957 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 1204 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 932 aa  272  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1236 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  38.74 
 
 		 735 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 827 aa  272  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 918 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 847 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1236 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 1238 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1234 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 759 aa  271  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1236 aa  271  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1039 aa  270  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.56 
 
 		 1763 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1596 aa  270  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 947 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  38.41 
 
 		 853 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1258 aa  270  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 1238 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 674 aa  270  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  37.23 
 
 		 764 aa  270  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  38.96 
 
 		 588 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 1110 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 1066 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  37.22 
 
 		 641 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1238 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 924 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 951 aa  269  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  33.93 
 
 		 1188 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  38.13 
 
 		 1028 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 		 785 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  39.09 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  37.59 
 
 		 539 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>