49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2454 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2454  DsrH family protein  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000310745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  37.5 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.04 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  31.07 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  31.07 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  34.62 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  33.65 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  30.19 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  28.43 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  30.39 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  30.1 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  30.11 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  32.38 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  27.88 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  31.73 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.73 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  32.35 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  26.21 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.13 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  30.84 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  30.84 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  31.37 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000044476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.13 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  31.37 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000156644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.13 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.37 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  34.31 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  31.37 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000271307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  30.39 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  31.37 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000136461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  30.84 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  31.37 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.0769099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0965  DsrH family protein  33.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.588711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  34.31 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  31.37 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000023417  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  29.13 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  30.84 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  30.84 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  30.84 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  30.84 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  27.18 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.13 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  30.84 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.35 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  31.37 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  31.37 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000315434  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  26.47 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2347  putative sulfur oxidation protein DsrH  29.13 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  31.37 
 
 		 95 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>