More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2406 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  74.21 
 
 		 233 aa  340  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  67.78 
 
 		 232 aa  334  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  71.95 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  65.98 
 
 		 246 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  65.98 
 
 		 246 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  65.98 
 
 		 246 aa  330  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  71.95 
 
 		 243 aa  328  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  71.04 
 
 		 263 aa  328  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  71.04 
 
 		 230 aa  327  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  65.57 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  69.82 
 
 		 240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  70.59 
 
 		 240 aa  325  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  69.68 
 
 		 241 aa  325  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  68.78 
 
 		 246 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  68.78 
 
 		 247 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  68.78 
 
 		 247 aa  324  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  68.78 
 
 		 246 aa  324  9e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  68.78 
 
 		 247 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  65.16 
 
 		 253 aa  311  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  53.88 
 
 		 240 aa  248  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  51.85 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  52.31 
 
 		 220 aa  241  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  51.38 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  48.18 
 
 		 237 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  51.6 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  50.68 
 
 		 235 aa  235  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.73 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.07 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  48.62 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.08 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.27 
 
 		 225 aa  228  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 241 aa  228  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.43 
 
 		 225 aa  225  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.17 
 
 		 239 aa  224  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.44 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.33 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.3 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.54 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.83 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.11 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  46.79 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.91 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  45.45 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  48.2 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  47.95 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.36 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  46.88 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2280  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0760186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 226 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  40.42 
 
 		 291 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.29 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.29 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 226 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  47.71 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.33 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  48.62 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  46.33 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45.45 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.85 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  48.2 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 226 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.7 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  45.45 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.7 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  44.84 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  49.55 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.41 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.12 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.89 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  46.3 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  44.64 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.64 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.33 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  46.79 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  44.95 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>