More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2332 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  554  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  70.61 
 
 		 271 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  50.2 
 
 		 268 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  49.03 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  48.86 
 
 		 271 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  49.03 
 
 		 282 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  48.22 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  48.62 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  48 
 
 		 253 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  48.41 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  50.21 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  50.86 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  48.59 
 
 		 298 aa  238  6.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  46.09 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  47.29 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  45.42 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  48.39 
 
 		 301 aa  218  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  43.57 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  45.04 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  43.57 
 
 		 287 aa  215  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  47.03 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  41.2 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  42.91 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  48.09 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  44.22 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  44.22 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  44.9 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  44.49 
 
 		 279 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  45.99 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  43.53 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  43.53 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  43.53 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  43.53 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  43.5 
 
 		 274 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  43.14 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  48.7 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  37.12 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  32.85 
 
 		 276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  36.07 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  39.44 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  35.78 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  40.1 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  33.61 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  38.42 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  44.67 
 
 		 205 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  41.46 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  37.38 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  40.49 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  35.87 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  36.18 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  36.95 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.65 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  36.45 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  40.49 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  34.82 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  36.36 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  34.87 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  35.32 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  36.36 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  32.55 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  34.47 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  36.63 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  35.32 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  36.17 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  35.64 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  32.18 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  36.12 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  35.78 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  35.64 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  34.93 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  34.82 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  28.44 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  33 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  32.5 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  35.86 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  35.09 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  33.83 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  36.15 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.19 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  36.54 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  32.62 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  37.43 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  32 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  35 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  32.5 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  32.5 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  33.65 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  34.95 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  33.5 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  34.98 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  32.8 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  31.8 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  34.52 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  34.5 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  36.06 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  33.82 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  34.5 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  32.67 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  35.82 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>