More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2290 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  74.16 
 
 		 215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  47.39 
 
 		 212 aa  198  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  45.1 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  45.81 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.71 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  47.26 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  47.26 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  45.24 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  47.26 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  47.26 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  47.26 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  47.26 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  44.66 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  39.73 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.32 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 212 aa  158  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.07 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  39.72 
 
 		 231 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.46 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.01 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  37.04 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.2 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  38.97 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  38.97 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  37.26 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 242 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 228 aa  147  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  43.9 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  33.18 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  38.97 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  38.97 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  38.97 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  38.97 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  38.97 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  37.44 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.19 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  34.74 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  37.26 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.19 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>