14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2242 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2242  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  630  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4005  hypothetical protein  26.64 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0670  hypothetical protein  25.84 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0641  hypothetical protein  28.1 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3854  hypothetical protein  29 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000149063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39040  hypothetical protein  29.58 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3379  hypothetical protein  28.1 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000346578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3671  hypothetical protein  29.5 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.286479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0597  hypothetical protein  28.5 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3728  hypothetical protein  28.5 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0641  hypothetical protein  26.44 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000277282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0528  hypothetical protein  28.37 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2988  hypothetical protein  27.78 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1386  hypothetical protein  31.48 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>