More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2221 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 		 283 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  43.8 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  40.88 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  41.24 
 
 		 276 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.28 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  38.52 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  38.52 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.75 
 
 		 289 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  39.66 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.19 
 
 		 285 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.52 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  39.71 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  44.54 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.18 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.28 
 
 		 285 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  39.64 
 
 		 284 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  41.07 
 
 		 284 aa  215  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.51 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  39.29 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.76 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  39.93 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.71 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.71 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.57 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  38.57 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  38.57 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.57 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.21 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  38.63 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.57 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.57 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 281 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.21 
 
 		 281 aa  198  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.86 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  35.38 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.86 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.55 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  35.38 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.46 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  38.79 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.01 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.49 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  35.97 
 
 		 289 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  35.61 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.04 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.77 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  37.54 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  37.32 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  38.25 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.25 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  36.65 
 
 		 477 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  37.06 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.92 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.64 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.33 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.55 
 
 		 285 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.3 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.3 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  36.2 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.3 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.3 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.92 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  35.61 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.83 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  35.34 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  35.16 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.86 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.94 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  33.79 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.74 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  34.06 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.97 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  32.86 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.82 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  33.2 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60020  thiosulfate sulfurtransferase  36.25 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.509685  normal  0.0271874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  32.36 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  31.16 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  35.27 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.58 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.58 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 		 271 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  29.5 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>