More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2006 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  55.38 
 
 		 635 aa  674    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 635 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  55.7 
 
 		 635 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 		 638 aa  699    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  52.8 
 
 		 645 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  55.22 
 
 		 635 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  55.7 
 
 		 636 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  56.56 
 
 		 637 aa  725    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  53.68 
 
 		 640 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  53.8 
 
 		 641 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  54.18 
 
 		 641 aa  697    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  57.43 
 
 		 639 aa  722    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  54.5 
 
 		 637 aa  686    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  54.26 
 
 		 649 aa  688    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  53.06 
 
 		 638 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  57.95 
 
 		 636 aa  710    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  53.01 
 
 		 638 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  55.22 
 
 		 635 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  55.22 
 
 		 635 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  53.68 
 
 		 640 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  55.38 
 
 		 635 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  55.54 
 
 		 635 aa  685    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  55.38 
 
 		 635 aa  674    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  57.72 
 
 		 639 aa  716    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  55.38 
 
 		 635 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  54.7 
 
 		 642 aa  672    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  54.18 
 
 		 641 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  64.33 
 
 		 646 aa  842    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  56.76 
 
 		 634 aa  712    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  54.62 
 
 		 639 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  55.22 
 
 		 635 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  55.38 
 
 		 635 aa  674    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  51.64 
 
 		 640 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  55.38 
 
 		 635 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  54.18 
 
 		 641 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  53.44 
 
 		 639 aa  668    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  56.4 
 
 		 637 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  100 
 
 		 647 aa  1324    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  53.42 
 
 		 645 aa  668    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  55.22 
 
 		 635 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  57.21 
 
 		 639 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0797  ABC transporter ATPase component  55.28 
 
 		 644 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131165  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  53.99 
 
 		 640 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  53.83 
 
 		 640 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  54.18 
 
 		 641 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  53.65 
 
 		 638 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  56.4 
 
 		 637 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  55.38 
 
 		 635 aa  675    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  49.08 
 
 		 640 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  47.57 
 
 		 643 aa  595  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  49.61 
 
 		 631 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  49.61 
 
 		 623 aa  595  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  50.08 
 
 		 645 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  47.48 
 
 		 632 aa  588  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  49.53 
 
 		 633 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 		 637 aa  587  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  49.38 
 
 		 642 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  46.99 
 
 		 642 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  48.24 
 
 		 650 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  48.03 
 
 		 627 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  45.19 
 
 		 653 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  48.87 
 
 		 615 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  45.78 
 
 		 648 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  46.71 
 
 		 635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  46.92 
 
 		 663 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  47 
 
 		 636 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  46.29 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  48.68 
 
 		 642 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  45.08 
 
 		 648 aa  566  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  46.37 
 
 		 641 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  48.68 
 
 		 642 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  48.53 
 
 		 642 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 632 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 637 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  45.9 
 
 		 649 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  45.75 
 
 		 649 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  49 
 
 		 641 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  48.59 
 
 		 636 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  45.51 
 
 		 642 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  47.09 
 
 		 631 aa  559  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  45.75 
 
 		 649 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  45.62 
 
 		 661 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  45.75 
 
 		 649 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  45.62 
 
 		 661 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 		 636 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  48.91 
 
 		 640 aa  558  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  46.03 
 
 		 645 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 641 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  48.21 
 
 		 639 aa  558  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  45.67 
 
 		 648 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  44.11 
 
 		 626 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 		 636 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  46.06 
 
 		 641 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  45.93 
 
 		 688 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 		 639 aa  548  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 1065 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 		 660 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 		 660 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 		 660 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 648 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>