245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1994 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  75.12 
 
 		 431 aa  644    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 448 aa  879    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  64.65 
 
 		 449 aa  578  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  56.18 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  53.71 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  55.13 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  47.86 
 
 		 458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  48.87 
 
 		 452 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  47.6 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  47.95 
 
 		 452 aa  428  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  50.23 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  48.63 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  48.4 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  45.29 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  45.29 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  48.65 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  45.29 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  45.07 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  44.84 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  47.82 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  40.09 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.25 
 
 		 455 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  39.44 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  35.16 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  35.82 
 
 		 473 aa  246  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  37.21 
 
 		 474 aa  239  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.41 
 
 		 455 aa  236  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37.07 
 
 		 449 aa  236  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  33.26 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.24 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.28 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.41 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.91 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  36.15 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  34.29 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.19 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  34.91 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  35.16 
 
 		 461 aa  230  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.55 
 
 		 453 aa  229  6e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  37.14 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.98 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.88 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  37.34 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.27 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  35.45 
 
 		 443 aa  225  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  33.48 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  33.04 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  33.04 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  33.04 
 
 		 446 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  33.48 
 
 		 446 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  33.48 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  33.26 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  33.26 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  32.83 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  36 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  34.91 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  34.19 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.9 
 
 		 450 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  35.6 
 
 		 447 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  34 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  34.46 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  32.76 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.16 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  34.87 
 
 		 453 aa  212  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  32.84 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  34.16 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.91 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  34.93 
 
 		 447 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  34.51 
 
 		 445 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  34.29 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  34.29 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 451 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  34.73 
 
 		 454 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  34.07 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  34.29 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  34.29 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  34.29 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  34.07 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  33.62 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  31.9 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  35.41 
 
 		 446 aa  206  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  32.1 
 
 		 450 aa  206  8e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  32.54 
 
 		 450 aa  206  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  34.14 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  32.69 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  31.85 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  32.97 
 
 		 456 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  34.16 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  34.56 
 
 		 461 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1223  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.6 
 
 		 449 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  34.28 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  32.63 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  32.98 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  33.05 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  32.9 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  34.4 
 
 		 455 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>