266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1982 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  66.84 
 
 		 569 aa  782    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  53.04 
 
 		 669 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  69.8 
 
 		 607 aa  859    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  54.33 
 
 		 637 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 619 aa  1252    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  54.71 
 
 		 622 aa  663    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  52.9 
 
 		 670 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  53.46 
 
 		 670 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  53.46 
 
 		 673 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  53.54 
 
 		 616 aa  628  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  52.38 
 
 		 666 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  54.27 
 
 		 719 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  51.97 
 
 		 643 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  55.73 
 
 		 625 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  52.87 
 
 		 660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  50.84 
 
 		 651 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  52.87 
 
 		 660 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  53.16 
 
 		 660 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  52.71 
 
 		 660 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  53.44 
 
 		 702 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  50.76 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  50.68 
 
 		 601 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  49.33 
 
 		 611 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  49.17 
 
 		 611 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  49.32 
 
 		 602 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  50.17 
 
 		 601 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  49.83 
 
 		 601 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  46.79 
 
 		 598 aa  538  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  46.58 
 
 		 599 aa  530  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  46.91 
 
 		 602 aa  515  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  44.54 
 
 		 597 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  43.65 
 
 		 599 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  43.37 
 
 		 760 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  43.37 
 
 		 617 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  42.28 
 
 		 764 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  41.95 
 
 		 763 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  43.29 
 
 		 611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  43.28 
 
 		 616 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  40.26 
 
 		 852 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  33.56 
 
 		 604 aa  340  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  33.05 
 
 		 606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 		 596 aa  309  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.1 
 
 		 596 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.1 
 
 		 596 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  33.39 
 
 		 596 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.21 
 
 		 596 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.1 
 
 		 596 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.21 
 
 		 596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.93 
 
 		 640 aa  301  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 		 623 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  35.63 
 
 		 625 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 		 584 aa  270  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  38.92 
 
 		 660 aa  257  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  32.9 
 
 		 640 aa  244  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 		 741 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  34.67 
 
 		 652 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  34.67 
 
 		 652 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  32.48 
 
 		 641 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 		 628 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  32.79 
 
 		 607 aa  229  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 629 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 639 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 637 aa  217  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  28.52 
 
 		 595 aa  216  8e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 610 aa  209  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  34.08 
 
 		 620 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  41.42 
 
 		 593 aa  205  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 		 609 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  33.71 
 
 		 617 aa  203  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  38.06 
 
 		 407 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  29.49 
 
 		 612 aa  195  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  29.92 
 
 		 617 aa  190  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.11 
 
 		 630 aa  180  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.82 
 
 		 626 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  34.38 
 
 		 421 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.44 
 
 		 628 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.33 
 
 		 399 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.14 
 
 		 402 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.05 
 
 		 401 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.36 
 
 		 399 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.05 
 
 		 401 aa  141  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.31 
 
 		 414 aa  140  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.49 
 
 		 414 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.49 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.52 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  29.87 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  30.15 
 
 		 597 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  30.63 
 
 		 597 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.82 
 
 		 597 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  29.57 
 
 		 597 aa  112  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  29.11 
 
 		 598 aa  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  29.32 
 
 		 597 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.85 
 
 		 597 aa  107  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 605 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 588 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 574 aa  97.4  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  26.06 
 
 		 505 aa  94.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 431 aa  94.7  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  31.32 
 
 		 498 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  26.77 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>