157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1961 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 260 aa  551  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  77.78 
 
 		 253 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.52 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  41.15 
 
 		 283 aa  221  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.16 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  27.97 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  31.39 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.34 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  26.69 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  27.49 
 
 		 311 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.97 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  27.57 
 
 		 302 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  28.35 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  29.32 
 
 		 306 aa  92  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.82 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.95 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.95 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  25 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  27.63 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  27.19 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.77 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  23.73 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.64 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  25.3 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  24.9 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  24.89 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  24.7 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.31 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.31 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.66 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.91 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.37 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  24.9 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.46 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.61 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.39 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  25.75 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.38 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.2 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  27 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.29 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  26.54 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.54 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  26.54 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.54 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  26.42 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  26.54 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.51 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.16 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  26.42 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  26.42 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  26.54 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.61 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.05 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.7 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  26.54 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  25.54 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.91 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  31.54 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.11 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.35 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.95 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  22.71 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  27.57 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  25.11 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  24.22 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  28.63 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.81 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  26.34 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.61 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.61 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.73 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.38 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.83 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  24.58 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.27 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.98 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  24.05 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.15 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.18 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  23.79 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.56 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.59 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  25.71 
 
 		 409 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.17 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  23.65 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>