More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1919 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 309 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  53.87 
 
 		 329 aa  345  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  35.26 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  34.84 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 		 290 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  34.74 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  32.35 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 		 328 aa  145  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  30.5 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.7 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.62 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  24.84 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.52 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.16 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>