75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1893 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1893  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00822676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1846  glyoxalase family protein  52.8 
 
 		 143 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0803  glyoxalase family protein  50.39 
 
 		 130 aa  138  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1625  hypothetical protein  48.82 
 
 		 134 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00462297  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5689  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.2 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883457  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1345  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.84 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000291195  normal  0.059306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4733  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.04 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1306  hypothetical protein  45.16 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.6 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.135989 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34859  predicted protein  42.75 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0311877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2031  catechol 2,3 dioxygenase  28.08 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2053  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.573082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1615  Catechol 2,3-dioxygenase  27.74 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127452  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  30.43 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2195  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 		 130 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.811141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  35.58 
 
 		 143 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 133 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0218  catechol 2,3-dioxygenase  28.23 
 
 		 303 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.158959 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.14 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000010528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3818  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.58 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.475756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.14 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310756  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.14 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657624  decreased coverage  0.000000082582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1949  methylmalonyl-CoA epimerase  26.62 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.331779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3206  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.71 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000404623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  26.43 
 
 		 324 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4919  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.66 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1588  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.81 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0529  catechol 2,3 dioxygenase  27.05 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3459  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.94 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1454  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  29.13 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2570  catechol 2,3-dioxygenase  24.31 
 
 		 335 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.67 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2432  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2413  catechol 2,3-dioxygenase  24.84 
 
 		 335 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.47 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.88 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  30.6 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.43 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000178969  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.87 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000152154  decreased coverage  0.00078643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  32.14 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  31.48 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  35.56 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29360  glyoxalase, Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  28.46 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.3 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0308  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0496645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 128 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3109  catechol 2,3 dioxygenase  24.19 
 
 		 309 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0110217  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1367  glyoxalase family protein  24.43 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  34.57 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.52 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.349547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6190  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 		 123 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  27.94 
 
 		 309 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.91 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00580  glyoxalase family protein  30.21 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  35.56 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0240  Catechol 2,3-dioxygenase  25 
 
 		 362 aa  40.8  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  30.23 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0728  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.91 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.570083  normal  0.0191793 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.98 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0319088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  27.71 
 
 		 135 aa  40.8  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4704  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.91 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.6 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0524594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.91 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068361 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2503  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  27.47 
 
 		 321 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>