More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1861 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  76.4 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  71.83 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  63.75 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  64.14 
 
 		 263 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  64.14 
 
 		 263 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  58.27 
 
 		 290 aa  295  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  56.37 
 
 		 292 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  55.98 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  57.75 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  58.3 
 
 		 280 aa  285  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  60 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  56.57 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  54.9 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  63.04 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  55.21 
 
 		 297 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  61.74 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  59.58 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  59.58 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  59.02 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  60.26 
 
 		 272 aa  275  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  54.83 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  54.83 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  54.83 
 
 		 297 aa  271  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  61.66 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  56.02 
 
 		 269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  53.06 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  52.51 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  55.06 
 
 		 295 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  54.27 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  50.41 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2590  efflux ABC transporter, permease protein  52.28 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.96 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  30.97 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.49 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  33.95 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.25 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.17 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.05 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.6 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.1 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.48 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.48 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 289 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.89 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 285 aa  95.1  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.28 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.72 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  29.63 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  32.8 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.64 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.53 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.23 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.31 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.3 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.19 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.79 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  26.05 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0998  transporter, putative  33.86 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2111  ABC-2 type transporter, permease protein  33.86 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2251  putative ABC transport system, membrane protein  33.86 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2056  ABC-2 type transporter, permease protein  33.86 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  23.98 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  24 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>