More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1841 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  100 
 
 
554 aa  1166    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  51.96 
 
 
514 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  35.1 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  33.96 
 
 
481 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  31.23 
 
 
500 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  30.24 
 
 
431 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  28.6 
 
 
518 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  30.97 
 
 
451 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3336  sulfatase  32.03 
 
 
482 aa  191  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.990519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2349  sulfatase  31.57 
 
 
437 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  28.57 
 
 
614 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5209  sulfatase  28.23 
 
 
603 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5650  sulfatase  28.23 
 
 
603 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.372268  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  29.84 
 
 
465 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2367  sulfatase family protein  28.03 
 
 
558 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  29.72 
 
 
549 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  30.96 
 
 
465 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  30.96 
 
 
465 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  30.96 
 
 
465 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1562  sulfatase  31.06 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  27.64 
 
 
511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  27.09 
 
 
607 aa  164  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  27.43 
 
 
523 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0762  sulfatase  29.65 
 
 
576 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.378263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  28.4 
 
 
478 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3375  sulfatase  29.55 
 
 
474 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  27.15 
 
 
520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  28.12 
 
 
474 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  27.52 
 
 
458 aa  148  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  27.34 
 
 
627 aa  146  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2626  sulfatase  27.06 
 
 
624 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  26.1 
 
 
524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1723  sulfatase  28.39 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  28.05 
 
 
506 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  25.99 
 
 
478 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0706  sulfatase  26.5 
 
 
576 aa  137  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.01 
 
 
501 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  26.79 
 
 
522 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  26.72 
 
 
483 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  25.86 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  26.16 
 
 
453 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  27.22 
 
 
535 aa  130  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.33 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  24.6 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  29.29 
 
 
621 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  25.48 
 
 
526 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  25.99 
 
 
481 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  22.7 
 
 
480 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.1 
 
 
497 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  24.3 
 
 
537 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  28.19 
 
 
584 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.67 
 
 
497 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.48 
 
 
497 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1566  sulfatase  25.71 
 
 
630 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145604  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  25.85 
 
 
453 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.67 
 
 
497 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.67 
 
 
497 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  24.7 
 
 
480 aa  123  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3657  sulfatase  25.76 
 
 
494 aa  123  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000376885  normal  0.0602445 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  25.05 
 
 
490 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  25.32 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  27.46 
 
 
541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  26.03 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  24.9 
 
 
564 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  25.98 
 
 
465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  30.19 
 
 
534 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  28.04 
 
 
457 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  24.3 
 
 
517 aa  120  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  25.97 
 
 
447 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  26.82 
 
 
497 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  24.96 
 
 
500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  32.14 
 
 
542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  27.38 
 
 
468 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  26.17 
 
 
536 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  27.49 
 
 
536 aa  117  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  26.08 
 
 
536 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  24.59 
 
 
484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  25.37 
 
 
474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  25.05 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  29.79 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  28.39 
 
 
485 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  26.33 
 
 
497 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  26.77 
 
 
555 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  25.34 
 
 
571 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  24.32 
 
 
486 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  29.3 
 
 
631 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  25.9 
 
 
563 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  24.33 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  23.99 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  24.24 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  26.07 
 
 
563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  26.6 
 
 
487 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  25.43 
 
 
491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4646  sulfatase  24.85 
 
 
461 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  25.15 
 
 
466 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  27.32 
 
 
510 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  25 
 
 
535 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0054  sulfatase  29 
 
 
461 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  25 
 
 
535 aa  110  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  25 
 
 
535 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>