42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1827 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 911 aa  1898    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.45 
 
 		 887 aa  689    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.76 
 
 		 837 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.92 
 
 		 860 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  31.07 
 
 		 823 aa  379  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.98 
 
 		 834 aa  365  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.42 
 
 		 863 aa  357  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.65 
 
 		 829 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  27.63 
 
 		 816 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1057 aa  333  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.87 
 
 		 862 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  28.79 
 
 		 836 aa  320  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  27.81 
 
 		 885 aa  319  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.58 
 
 		 852 aa  312  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  27.65 
 
 		 858 aa  292  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  25.57 
 
 		 871 aa  286  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.33 
 
 		 848 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.91 
 
 		 845 aa  252  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.17 
 
 		 848 aa  249  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.57 
 
 		 850 aa  238  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.12 
 
 		 831 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  29.57 
 
 		 840 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  25.16 
 
 		 906 aa  180  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  21.9 
 
 		 923 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  22.73 
 
 		 983 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.22 
 
 		 874 aa  111  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.8 
 
 		 923 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  21.16 
 
 		 932 aa  97.8  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.65 
 
 		 910 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.55 
 
 		 942 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  23.64 
 
 		 931 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.1 
 
 		 631 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.18 
 
 		 526 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.33 
 
 		 581 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.33 
 
 		 581 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.86 
 
 		 581 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.17 
 
 		 580 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.73 
 
 		 618 aa  47.8  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.92 
 
 		 559 aa  47  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.56 
 
 		 615 aa  47  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.89 
 
 		 506 aa  46.2  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  24.41 
 
 		 592 aa  45.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>