More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1804 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 473 aa  978    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  52.33 
 
 		 479 aa  531  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  51.48 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  51.91 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.74 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  49.79 
 
 		 474 aa  508  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.6 
 
 		 472 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.22 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  49.34 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.46 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  50.33 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  48.36 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.58 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  49.78 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  50.66 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  51.75 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  45.88 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  48.12 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  41.19 
 
 		 473 aa  382  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  43.61 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  45.59 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  43.36 
 
 		 602 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  41.56 
 
 		 477 aa  345  8e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  42.79 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  40.94 
 
 		 470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  38.95 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  40.27 
 
 		 477 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  37.47 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  43.67 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.11 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  39.61 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.18 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 		 478 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  41.07 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  40.71 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  37.28 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.87 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  38.6 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  40.17 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  37.55 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  38.26 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  38.53 
 
 		 456 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  37.14 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  39.21 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.67 
 
 		 448 aa  240  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.13 
 
 		 469 aa  240  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  33.26 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.91 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  30.09 
 
 		 462 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  32.91 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 		 466 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.77 
 
 		 490 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  31.93 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.62 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  33.7 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.74 
 
 		 436 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.74 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.33 
 
 		 462 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  28.29 
 
 		 705 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  28.11 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.51 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.51 
 
 		 444 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  26.93 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.28 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  32.65 
 
 		 764 aa  164  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  31.19 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  30.75 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  29.44 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.07 
 
 		 734 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  26.05 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  27.25 
 
 		 753 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.02 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.72 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  28.54 
 
 		 596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.97 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  26.71 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  27.87 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.34 
 
 		 462 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  30.8 
 
 		 480 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 		 726 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  27.41 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  28.33 
 
 		 752 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 758 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  30.08 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.05 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  28.48 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  30.04 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.61 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  28.85 
 
 		 446 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  28.23 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  30.69 
 
 		 439 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 473 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3416  berberine/berberine domain-containing protein  37.06 
 
 		 202 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>