More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1803 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  46.76 
 
 
694 aa  635    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  100 
 
 
731 aa  1515    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.79 
 
 
626 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.63 
 
 
626 aa  588  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.15 
 
 
626 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.97 
 
 
641 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.37 
 
 
636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  43.26 
 
 
630 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  41.94 
 
 
646 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.51 
 
 
632 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.47 
 
 
706 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.43 
 
 
907 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.5 
 
 
924 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.33 
 
 
705 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  37.92 
 
 
681 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  37.56 
 
 
634 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.56 
 
 
626 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.48 
 
 
631 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.18 
 
 
626 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.85 
 
 
629 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  33.49 
 
 
640 aa  359  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
655 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.75 
 
 
629 aa  356  6.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.68 
 
 
632 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.98 
 
 
688 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.18 
 
 
682 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.36 
 
 
644 aa  331  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.75 
 
 
642 aa  330  8e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.66 
 
 
650 aa  328  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.56 
 
 
686 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.12 
 
 
686 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.59 
 
 
655 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  31.94 
 
 
759 aa  290  6e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.32 
 
 
666 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.15 
 
 
656 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  30.71 
 
 
678 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  30.5 
 
 
657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.81 
 
 
652 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.92 
 
 
638 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.53 
 
 
615 aa  230  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.49 
 
 
665 aa  221  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.27 
 
 
632 aa  220  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  29.26 
 
 
638 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40 
 
 
653 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.27 
 
 
656 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.68 
 
 
610 aa  197  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.05 
 
 
597 aa  195  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.46 
 
 
654 aa  193  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.77 
 
 
657 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  27.78 
 
 
596 aa  187  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.27 
 
 
594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.76 
 
 
653 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4496  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.17 
 
 
657 aa  184  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.597999  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.01 
 
 
659 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  25.56 
 
 
642 aa  180  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.78 
 
 
654 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  28.25 
 
 
653 aa  179  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.09 
 
 
665 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.36 
 
 
600 aa  177  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 
654 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
662 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.12 
 
 
596 aa  172  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  25.83 
 
 
649 aa  172  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.68 
 
 
623 aa  171  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.15 
 
 
644 aa  170  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.24 
 
 
662 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.24 
 
 
662 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.03 
 
 
662 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.45 
 
 
588 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  31.61 
 
 
645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.43 
 
 
645 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.72 
 
 
612 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.52 
 
 
649 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.43 
 
 
645 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.43 
 
 
645 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.89 
 
 
645 aa  163  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
661 aa  163  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.38 
 
 
665 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  27.07 
 
 
662 aa  161  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.65 
 
 
662 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.29 
 
 
638 aa  161  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.04 
 
 
628 aa  160  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  22.85 
 
 
648 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.57 
 
 
661 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.17 
 
 
755 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.91 
 
 
642 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.14 
 
 
611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.98 
 
 
607 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.57 
 
 
645 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.49 
 
 
650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  27.41 
 
 
665 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
571 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.47 
 
 
695 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.93 
 
 
646 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.17 
 
 
683 aa  146  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.02 
 
 
617 aa  144  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.6 
 
 
634 aa  144  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.6 
 
 
629 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.35 
 
 
688 aa  143  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.96 
 
 
621 aa  140  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>