131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1770 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  100 
 
 
419 aa  879    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  57.07 
 
 
419 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  57.56 
 
 
419 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  56.94 
 
 
429 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  56.46 
 
 
410 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  56.97 
 
 
407 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  57.25 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  52.55 
 
 
414 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  48.94 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  42.13 
 
 
410 aa  364  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  34.69 
 
 
476 aa  206  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
956 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
994 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
456 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
1340 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
535 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  30.14 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  26.93 
 
 
1119 aa  130  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
902 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
703 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.03 
 
 
700 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  25.5 
 
 
860 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
1106 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
1156 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
499 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  38.71 
 
 
442 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  25.43 
 
 
537 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
274 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
389 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
691 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  24.22 
 
 
537 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
691 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  31.43 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
824 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
691 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
683 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  32 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  34.58 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.77 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  28.57 
 
 
413 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
406 aa  67  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  27.46 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.08 
 
 
429 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  33.02 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  27.08 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
892 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
417 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  23.15 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
409 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
401 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  27.7 
 
 
399 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  26.12 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
415 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  32.64 
 
 
402 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
422 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
396 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  31.86 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  29.13 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  31.69 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  25.33 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>