33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1760 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1760  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  36.13 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1291  hypothetical protein  36.36 
 
 		 184 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  35.45 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003821  hypothetical protein  35.14 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0228492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  34.21 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  40.57 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  38.53 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  35.58 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  35.58 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  37.25 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  31.58 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  37.74 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  29.13 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  35.34 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1354  hypothetical protein  31.86 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  34.75 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  29.82 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02428  hypothetical protein  25.45 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  36.17 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  31.11 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01018  hypothetical protein  29.41 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000655555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  27.19 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  25.89 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  29.09 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2422  hypothetical protein  23.14 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>