275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1747 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 467 aa  968    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.32 
 
 		 466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.34 
 
 		 455 aa  461  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  47.01 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  47.31 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  47.53 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  46.47 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.32 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.56 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  44.06 
 
 		 476 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.35 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  44.95 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  45.83 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  45.49 
 
 		 478 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  46.81 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  45.39 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.39 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  45.27 
 
 		 480 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.05 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.05 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  46.67 
 
 		 489 aa  395  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.05 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  46.43 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  43.36 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  43.67 
 
 		 522 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  42.46 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  40.39 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  41.59 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.45 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  44.35 
 
 		 470 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  43.51 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  42.01 
 
 		 525 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 524 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  41.94 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.91 
 
 		 541 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.77 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  41.65 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  43.27 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.73 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  41.7 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.23 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  40.99 
 
 		 464 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  41.24 
 
 		 536 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  42.05 
 
 		 536 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  42.7 
 
 		 547 aa  362  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  42.89 
 
 		 531 aa  361  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  41.3 
 
 		 465 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  42.33 
 
 		 515 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.87 
 
 		 530 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  40.13 
 
 		 464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.85 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.28 
 
 		 471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 536 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.57 
 
 		 536 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  42.83 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.7 
 
 		 525 aa  347  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.83 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  39.78 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 		 468 aa  342  1e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  40.52 
 
 		 462 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  40.52 
 
 		 462 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  37.94 
 
 		 535 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  41.56 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.17 
 
 		 470 aa  326  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.62 
 
 		 469 aa  325  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.38 
 
 		 469 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  39.2 
 
 		 447 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  39.21 
 
 		 547 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  40.21 
 
 		 468 aa  316  5e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  39.01 
 
 		 466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.77 
 
 		 464 aa  312  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.31 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.25 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  37.88 
 
 		 460 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  37.88 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  38.05 
 
 		 540 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  38.85 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  36.91 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  38.83 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  37.95 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  39.91 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  38.33 
 
 		 542 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  37.01 
 
 		 452 aa  295  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  37.2 
 
 		 473 aa  295  9e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  38.66 
 
 		 452 aa  295  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.17 
 
 		 452 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  38.63 
 
 		 532 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  35.62 
 
 		 455 aa  293  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  36.93 
 
 		 454 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  37.47 
 
 		 455 aa  292  9e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  37.39 
 
 		 589 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>