More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1638 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 127 aa  267  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  60.16 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  59.68 
 
 		 166 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  59.68 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  56.35 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 134 aa  155  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  54.76 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 134 aa  153  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  51.64 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  56.56 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  54.47 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  53.6 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  53.72 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  50.82 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  55.46 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  52 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2822  methionine-R-sulfoxide reductase  53.78 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  56.1 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  55 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  56.1 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  56.1 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  56.1 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  56.1 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  56.67 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  56.56 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 133 aa  147  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  53.49 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  51.67 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.72 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  48.8 
 
 		 138 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  57.76 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  57.76 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  54.1 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  54.1 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  52.07 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  54.1 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  55 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  54.62 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  51.97 
 
 		 141 aa  145  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  50.4 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  53.78 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  56.9 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  47.54 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  48.78 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  52.8 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  50.81 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 		 177 aa  141  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  49.61 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  52.42 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  52.42 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  54.7 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  50.41 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  49.21 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 146 aa  141  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>