265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1626 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 197 aa  411  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  53.97 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  44.22 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  41.36 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  46.45 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  39.66 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  43.21 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 214 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  41.85 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  42.77 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  38.14 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  40.99 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  39.49 
 
 		 168 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  39.49 
 
 		 168 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  42.77 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 228 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 171 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 234 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.61 
 
 		 427 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  43.37 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.1 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.1 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  39.64 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.1 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.61 
 
 		 427 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.61 
 
 		 483 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.61 
 
 		 333 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  38.54 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 177 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 221 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1805  NUDIX hydrolase  39.27 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000497318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.76 
 
 		 347 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  34.21 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  36.98 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1942  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000158411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1949  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112365  normal  0.784908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2377  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000154779  normal  0.335752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1916  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  37.89 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  36.46 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  36.46 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  36.46 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  36.46 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 242 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  36.59 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>