More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1557 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  100 
 
 		 321 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  49.35 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  42.76 
 
 		 264 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  41.48 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  43.99 
 
 		 260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  44.82 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  39.49 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  38.39 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  38.01 
 
 		 270 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  39.88 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  37.07 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  40.14 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  40.14 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  39.79 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  36.56 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  36.25 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  37.58 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  36.25 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  36.25 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  40.14 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  37.46 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  38.64 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  38.61 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.8 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  37.72 
 
 		 342 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  38.62 
 
 		 342 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  37.91 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  39.8 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  37.12 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  35.8 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  40.73 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  40.73 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  40.29 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  39.3 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  40.69 
 
 		 335 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  41.09 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  38.46 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  38.8 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  39.64 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  41.8 
 
 		 297 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.46 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  37.13 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  52.67 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  52.67 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  38.31 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  37.76 
 
 		 415 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  43.81 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  41.74 
 
 		 417 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  34.63 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  38.83 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  50.35 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  42.36 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  37.83 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  33.44 
 
 		 409 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  56 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  37.11 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  32.64 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  56.06 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  52.76 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  32.5 
 
 		 370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  33.44 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  48.19 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  33.44 
 
 		 265 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  56.67 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  48.03 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  55.37 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  31.01 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  31.01 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  53.66 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  56.9 
 
 		 239 aa  136  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  57.52 
 
 		 258 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  40.56 
 
 		 381 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  45.68 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  54.62 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  31.65 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  38.15 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  32.46 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  37.24 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  56.9 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  50.88 
 
 		 249 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  56.07 
 
 		 230 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  39.44 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  40.54 
 
 		 281 aa  133  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  56.76 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  55.26 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  55.26 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 474 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  55 
 
 		 186 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  55.26 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  47.69 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 468 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  50 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  42.51 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  43.79 
 
 		 419 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  41.8 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>