102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1555 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1555  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000623107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01651  hypothetical protein  82.76 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1711  hypothetical protein  62.07 
 
 		 87 aa  114  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.654442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3028  hypothetical protein  58.62 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3280  hypothetical protein  59.77 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000870695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3322  hypothetical protein  59.77 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000559481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3458  hypothetical protein  59.77 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00375963  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1087  hypothetical protein  59.77 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.0000064685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1163  hypothetical protein  58.62 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0986  hypothetical protein  58.62 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105204  normal  0.0165558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1051  hypothetical protein  58.62 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000671726  hitchhiker  0.00478592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0990  hypothetical protein  58.62 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000075069  normal  0.687839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2874  hypothetical protein  57.47 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000389579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2953  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1853  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3025  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00091395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1197  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00600  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0652819  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2995  protein of unknown function DUF493  54.02 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000919555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0683  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.58222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0656  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000367197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3014  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00679596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0651  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000004684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0620  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0719  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  0.764617 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00589  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2593  hypothetical protein  56.32 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00140819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1166  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332478  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01213  hypothetical protein  54.12 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004226  UPF0250 protein  54.12 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000561053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0692  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0108716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0752  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0969467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0796  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00125939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0678  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000567812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0738  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00130336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1088  hypothetical protein  57.47 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0973473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0469  hypothetical protein  51.76 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3490  hypothetical protein  51.72 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000408093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3154  hypothetical protein  49.43 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000128266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2968  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220242  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3713  hypothetical protein  50.57 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000213543  hitchhiker  0.00129495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0694  hypothetical protein  50.57 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0981  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1177  hypothetical protein  52.87 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3154  hypothetical protein  52.87 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0869  hypothetical protein  49.43 
 
 		 99 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2940  hypothetical protein  48.28 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000039404  normal  0.0192635 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0317  hypothetical protein  46.51 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.125842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0289  hypothetical protein  38.89 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.68869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0281  hypothetical protein  35.37 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0243  protein of unknown function DUF493  34.94 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2276  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2891  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2901  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.968413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6234  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2941  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2803  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2705  hypothetical protein  30.95 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0382  hypothetical protein  34.83 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0412  hypothetical protein  31.76 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0413  hypothetical protein  32.58 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327313  normal  0.0225093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0500  protein of unknown function DUF493  29.21 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0729827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2285  protein of unknown function DUF493  35.9 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2373  protein of unknown function DUF493  35.9 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.591302  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0224  hypothetical protein  29.27 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0326  hypothetical protein  29.76 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2499  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1578  hypothetical protein  34.62 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.979339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1968  protein of unknown function DUF493  29.21 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0056  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0622  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.534048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2409  hypothetical protein  30.86 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0222  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1371  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0440  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0460  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3190  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2238  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0188  hypothetical protein  29.27 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0239865  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3336  hypothetical protein  32.22 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000115113  normal  0.014798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0472  hypothetical protein  29.76 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3793  hypothetical protein  35.37 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0182  hypothetical protein  29.27 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2198  protein of unknown function DUF493  32.58 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.014859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0268  hypothetical protein  29.41 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1262  hypothetical protein  32.58 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.533779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4239  hypothetical protein  30.49 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0576  protein of unknown function DUF493  31.51 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1550  hypothetical protein  27.16 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1123  hypothetical protein  31.46 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.44189  normal  0.554686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12110  hypothetical protein  31.71 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1346  hypothetical protein  34.72 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000528768  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1409  hypothetical protein  34.72 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0107  hypothetical protein  28.57 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1111  hypothetical protein  30.49 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08440  hypothetical protein  30.49 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4879  protein of unknown function DUF493  28.57 
 
 		 104 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4216  hypothetical protein  43.9 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1265  protein of unknown function DUF493  28.95 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0383916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>