269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1460 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 384 aa  788    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  32.58 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  33.1 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  33.11 
 
 		 346 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  33.11 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  33.11 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  32.25 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  32.77 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  32.2 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  32.19 
 
 		 347 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  31.85 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  30.74 
 
 		 351 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  33.07 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  31.91 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  30.22 
 
 		 351 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  23.98 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.74 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  23.47 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  27.84 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  24.06 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  27.98 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  25.66 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  25 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  23.67 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  25.13 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  23.71 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  23.58 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  21.74 
 
 		 730 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  25.91 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  23.01 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  24.3 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  23.4 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  33.58 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  23.53 
 
 		 716 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  23.13 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  25.68 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  23.36 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  23.36 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  24.87 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  23.4 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  23.12 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  21.69 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  22.84 
 
 		 282 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  25.39 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  21.29 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  22.39 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  22.39 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  33.08 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  33.08 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  22.99 
 
 		 287 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  24.12 
 
 		 304 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  31.88 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  22.49 
 
 		 718 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  23.79 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  25.49 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  34.48 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  23.26 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  20.32 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  24.86 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  22.5 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  24.81 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  24.74 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  22.6 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  24.62 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  21.89 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  22.28 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  22.03 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  21.9 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  22.18 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  22.46 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  26.5 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  22.11 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  22.8 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>