56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1431 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  100 
 
 		 416 aa  864    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  42.16 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  43.27 
 
 		 326 aa  236  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  38.46 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  42.01 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  30.97 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  28.3 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  27.04 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.33 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  29.14 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  27.64 
 
 		 316 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  27.24 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25.79 
 
 		 927 aa  91.3  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  28.44 
 
 		 302 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  26.75 
 
 		 294 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  29.72 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  29.2 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  23.48 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  26.2 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  26.2 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  26.2 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  25.83 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  26.2 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  26.2 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  25.09 
 
 		 667 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  25.93 
 
 		 657 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  26.47 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  26.54 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  26.94 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  26.94 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  26.94 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  31.43 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  22.9 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  26.8 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  25.98 
 
 		 1397 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  25.41 
 
 		 533 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1557 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  26.32 
 
 		 1084 aa  49.7  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2782  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  29.67 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  25.24 
 
 		 1278 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  36.76 
 
 		 232 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  28.57 
 
 		 1370 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  25.9 
 
 		 1024 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2396  hypothetical protein  25.35 
 
 		 616 aa  47  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000510296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.98 
 
 		 1276 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  27.66 
 
 		 950 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  25.42 
 
 		 1114 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  26.36 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  23.12 
 
 		 930 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.89 
 
 		 1505 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  22.22 
 
 		 524 aa  43.9  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  27.53 
 
 		 214 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  23.13 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  21.54 
 
 		 676 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0122  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.78 
 
 		 308 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271646  normal  0.201393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>