More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1400 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  100 
 
 
287 aa  604  1e-172  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  67.84 
 
 
290 aa  421  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  55.99 
 
 
291 aa  340  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 
290 aa  295  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.3368e-07  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
290 aa  291  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.19929e-09  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
290 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.91416e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  46.45 
 
 
286 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
289 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  44.41 
 
 
289 aa  286  3e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.9607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  47.23 
 
 
289 aa  286  3e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  46.52 
 
 
289 aa  284  1e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 
289 aa  283  2e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.40538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 
289 aa  283  2e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.67219e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 
289 aa  283  2e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.20218e-09  hitchhiker  1.31905e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 
289 aa  283  2e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.49804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  44.72 
 
 
297 aa  282  4e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.46772e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  45.69 
 
 
289 aa  281  6e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.4464e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  43.16 
 
 
289 aa  278  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  41.43 
 
 
293 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  42.96 
 
 
294 aa  243  2e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.08227e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  40.71 
 
 
293 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.66037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  40.48 
 
 
292 aa  239  3e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  31.12 
 
 
296 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  27.99 
 
 
321 aa  134  2e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  27.61 
 
 
321 aa  133  4e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  28.42 
 
 
300 aa  130  2e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  29.81 
 
 
309 aa  126  4e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  26.99 
 
 
315 aa  126  4e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  28.77 
 
 
322 aa  119  4e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  45.45 
 
 
122 aa  119  5e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  28.98 
 
 
308 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  27.72 
 
 
302 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  28.62 
 
 
317 aa  117  2e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  28.62 
 
 
313 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  26.99 
 
 
294 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  26.99 
 
 
294 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  27.38 
 
 
301 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  27.49 
 
 
304 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  26.5 
 
 
324 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.61 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  23.08 
 
 
280 aa  79.7  5e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 
295 aa  78.2  1e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 
498 aa  73.2  5e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  21.91 
 
 
339 aa  71.6  2e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  37.23 
 
 
260 aa  70.5  3e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  4.47727e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
230 aa  68.9  8e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.15803e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
230 aa  68.9  8e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.80741e-07  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
230 aa  68.9  9e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.5492e-07  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  44.21 
 
 
230 aa  68.6  1e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  22.97 
 
 
350 aa  68.9  1e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  44.21 
 
 
230 aa  68.6  1e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.6276e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  44.21 
 
 
230 aa  68.6  1e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.40918e-08  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  44.21 
 
 
228 aa  68.2  1e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  38.89 
 
 
235 aa  68.6  1e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  44.21 
 
 
230 aa  68.6  1e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  22.47 
 
 
324 aa  67.8  2e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 
238 aa  67.4  3e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 
215 aa  66.2  6e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.71 
 
 
319 aa  65.5  9e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  6.51702e-11  n/a   
 
 
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.82 
 
 
217 aa  65.5  9e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.10424e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  38.82 
 
 
217 aa  65.1  1e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.64743e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  28.95 
 
 
890 aa  65.1  1e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.76 
 
 
506 aa  65.5  1e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  44.16 
 
 
220 aa  64.7  2e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
217 aa  64.3  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  33 
 
 
514 aa  64.7  2e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.61 
 
 
218 aa  63.9  3e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
296 aa  63.9  3e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  31.82 
 
 
264 aa  63.9  3e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  32.74 
 
 
237 aa  63.5  4e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.05 
 
 
260 aa  63.2  5e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  41.05 
 
 
228 aa  63.2  6e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  34 
 
 
270 aa  62.8  6e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  39.19 
 
 
225 aa  62.8  7e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  35 
 
 
271 aa  62.8  7e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  34.02 
 
 
260 aa  62.4  8e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  35.05 
 
 
269 aa  61.6  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  26.17 
 
 
380 aa  62  1e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
227 aa  62  1e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.78 
 
 
226 aa  62  1e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  41.89 
 
 
222 aa  62.4  1e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 
190 aa  62  1e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 
510 aa  61.6  1e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  37 
 
 
286 aa  61.2  2e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  32.71 
 
 
166 aa  60.8  2e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 
229 aa  61.2  2e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  35.05 
 
 
269 aa  60.8  2e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  33 
 
 
270 aa  61.2  2e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  34.02 
 
 
656 aa  61.2  2e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  42.47 
 
 
221 aa  61.2  2e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  30.63 
 
 
316 aa  60.8  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  32.71 
 
 
179 aa  60.5  3e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  30.7 
 
 
263 aa  60.5  3e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  35.58 
 
 
222 aa  60.8  3e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  32.71 
 
 
166 aa  60.5  3e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.64 
 
 
165 aa  60.5  3e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 
205 aa  60.8  3e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 
230 aa  60.8  3e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.64 
 
 
166 aa  60.5  3e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.74 
 
 
173 aa  60.5  3e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>