36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1267 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  100 
 
 		 261 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  53.21 
 
 		 262 aa  281  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  50.19 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0692  lipase, class 3  49.04 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141463  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  47.44 
 
 		 216 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  33.18 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  28.95 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  24.5 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  30.22 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  24.5 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  24.5 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  24 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  24.88 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  24 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  24 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  24 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  23.5 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  27.27 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  24.39 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  26.15 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  23.5 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  30.1 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  25.53 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  25 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3866  hypothetical protein  27.47 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595881  normal  0.582727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  28.66 
 
 		 336 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  27.37 
 
 		 234 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  24.63 
 
 		 726 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  25.39 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92920  predicted protein  36.61 
 
 		 507 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728823  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  25.32 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  25.39 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  26.62 
 
 		 379 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  36.11 
 
 		 641 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  24.76 
 
 		 383 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46753  predicted protein  30.09 
 
 		 405 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00406478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>