57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1195 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  749    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  43.09 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  34.69 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  31.69 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.14 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  30.59 
 
 		 348 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  29.94 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  35.86 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.86 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  31.37 
 
 		 471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.24 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  25.49 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  26.5 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.98 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  26.39 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  25.21 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  24.72 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.17 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  24.64 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  26.45 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  25.56 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  25.21 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  23.18 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  23.38 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  23.12 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  23.24 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  23.19 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  22.38 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  21.8 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  22.6 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  23.21 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  17.18 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  20.96 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  25.7 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  22.07 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  21.24 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  23.93 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  21.75 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  20.62 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.75 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  19.74 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  20.55 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0715  hypothetical protein  26.42 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.821886  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.46 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  21.76 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  21.83 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  20.69 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  21.2 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  20.82 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  20.54 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  25.84 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.37 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  20.07 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  22.54 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  21.5 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  20.38 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  18.82 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>