More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1193 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 371 aa  770    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  53.8 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 381 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.1 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 378 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.93 
 
 		 388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.87 
 
 		 745 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.8 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.99 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  29.85 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.46 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.52 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.27 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 750 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.15 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 373 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.12 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.12 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.12 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.12 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.12 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.01 
 
 		 367 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.47 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.66 
 
 		 745 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  25.41 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.14 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 373 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.14 
 
 		 369 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  25 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.14 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  28.62 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.62 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  25 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  25 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.84 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>