More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1136 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 235 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  45.92 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  41.41 
 
 		 204 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3656  phosphoglycerate mutase family protein  35.65 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  38.54 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 204 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 206 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.59 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  37 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  31.43 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 201 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  34.78 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.97 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  33.71 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 411 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 190 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.15 
 
 		 188 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  35.53 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 208 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 188 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  35.53 
 
 		 194 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.67 
 
 		 197 aa  95.5  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 191 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 		 193 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 378 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.6 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.6 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.22 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.6 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  35.53 
 
 		 189 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  30.45 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.14 
 
 		 427 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 195 aa  86.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.12 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  30.43 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.34 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.11 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  32.85 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.12 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.8 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.63 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.75 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  29.75 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.75 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  30.67 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.61 
 
 		 365 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.61 
 
 		 365 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.61 
 
 		 365 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  29.75 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.75 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  24.32 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.38 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  29.75 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.95 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  25.41 
 
 		 370 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.12 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 		 438 aa  72.8  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.15 
 
 		 378 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  26.9 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  30.07 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>