More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1104 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1104  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 455 aa  945    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  55.48 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  51.55 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 		 455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  50.88 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  51.99 
 
 		 480 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  50.44 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  50.44 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  50.22 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  50.22 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  50.22 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  50.22 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  50.22 
 
 		 485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  50 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  49.23 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  47.79 
 
 		 458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  48.88 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  49.78 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 446 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  49.55 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  47.76 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  47.76 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  47.76 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  47.76 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  48.34 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.3 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  45.41 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  47.17 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  46.96 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  44.76 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01054  coproporphyrinogen III oxidase  49.44 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.299097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  46.74 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  47.35 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  46.96 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.24 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  47.35 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.41 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  45.65 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  45.43 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.41 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.14 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  45.65 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  43.91 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  46.24 
 
 		 482 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  44.9 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  47.83 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  45.87 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  45.73 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  45.34 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  44.76 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  44.91 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.78 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  44.91 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  44.91 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  44.69 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 460 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  43.93 
 
 		 465 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  46.02 
 
 		 461 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  44.1 
 
 		 463 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 460 aa  405  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  44.13 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  44.1 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  43.11 
 
 		 473 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  42.98 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  42.98 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  42.98 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.01 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>