More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1070 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  64.15 
 
 
484 aa  641    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  100 
 
 
469 aa  972    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  54.86 
 
 
466 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  55.34 
 
 
466 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  50.55 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.61 
 
 
466 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  45.51 
 
 
466 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.48 
 
 
465 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3231  sugar transferase  45.61 
 
 
469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143756  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.16 
 
 
468 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.01 
 
 
464 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.1 
 
 
464 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3449  capsular polysaccharide biosynthesis protein  44.8 
 
 
469 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  43.14 
 
 
464 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.14 
 
 
464 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.14 
 
 
464 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.14 
 
 
464 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  43.14 
 
 
464 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.14 
 
 
464 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.92 
 
 
464 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.14 
 
 
464 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.76 
 
 
496 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2028  sugar transferase  45.54 
 
 
461 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.619807  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50.7 
 
 
468 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3172  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.45 
 
 
474 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.247578  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  51.84 
 
 
468 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.92 
 
 
464 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.92 
 
 
464 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.92 
 
 
464 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.7 
 
 
464 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.92 
 
 
464 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  46.41 
 
 
464 aa  359  7e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0310  sugar transferase  42.58 
 
 
454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.67 
 
 
471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  42.07 
 
 
464 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  50.62 
 
 
460 aa  348  9e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1125  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50.76 
 
 
393 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1875  sugar transferase  49.72 
 
 
477 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.05 
 
 
464 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.21 
 
 
472 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.9 
 
 
454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0239  sugar transferase  48.77 
 
 
472 aa  335  7e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5198  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.68 
 
 
465 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2680  sugar transferase  41.24 
 
 
474 aa  329  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0796334  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.87 
 
 
460 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  40.62 
 
 
456 aa  319  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.95 
 
 
467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  34.79 
 
 
457 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  45.17 
 
 
346 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.14 
 
 
477 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  51.7 
 
 
459 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  35.82 
 
 
468 aa  286  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3723  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.42 
 
 
457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0732572  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5546  sugar transferase  33.83 
 
 
477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383958  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  33.84 
 
 
478 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  33.84 
 
 
478 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.28 
 
 
457 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  39.49 
 
 
484 aa  279  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  35.67 
 
 
471 aa  279  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.63 
 
 
445 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.03 
 
 
460 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.03 
 
 
460 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.27 
 
 
471 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1536  GumD protein  35.6 
 
 
484 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  35.54 
 
 
460 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1480  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.82 
 
 
484 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0810813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  35.78 
 
 
460 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.14 
 
 
465 aa  269  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0765  putative lipopolysaccharide biosynthesis related protein  36.98 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.436958  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.05 
 
 
471 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  37.62 
 
 
512 aa  266  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.07 
 
 
475 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.68 
 
 
505 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.69 
 
 
506 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6264  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.97 
 
 
471 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0775  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.38 
 
 
512 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.8 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1856  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.52 
 
 
536 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.726353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.52 
 
 
518 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  35.19 
 
 
477 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  42.33 
 
 
471 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  35.56 
 
 
465 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2694  sugar transferase  34.55 
 
 
509 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.335678  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.29 
 
 
461 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  35.02 
 
 
464 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.42 
 
 
461 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2509  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.81 
 
 
516 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1925  sugar transferase  38.68 
 
 
506 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.56 
 
 
517 aa  259  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1154  sugar transferase  38.71 
 
 
510 aa  259  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3010  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.57 
 
 
478 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1713  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.72 
 
 
465 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.3 
 
 
506 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3529  capsular polysaccharide biosynthesis protein PslA  40.94 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3301  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.94 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.08 
 
 
468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  34.49 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0851  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.84 
 
 
547 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985925  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2682  sugar transferase  34.32 
 
 
514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  31.17 
 
 
461 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>