More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1054 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  100 
 
 		 436 aa  900    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03439  phosphate regulon sensor protein PhoR  66.05 
 
 		 433 aa  594  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 		 432 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1075  phosphate regulon sensor protein PhoR  49.77 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000451223  normal  0.527296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.83 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  49.42 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.2 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  49.19 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.2 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200806  hitchhiker  0.00000878354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.2 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.2 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2456  phosphate regulon sensor protein  46.99 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.18 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000859237  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  47.24 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 431 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 		 439 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0254  phosphate regulon sensor protein  48.13 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  47.24 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  47.15 
 
 		 431 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  47.24 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  47.15 
 
 		 431 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  47.47 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  47.47 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  47.24 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  47.67 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  47.24 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1209  phosphate regulon sensor protein PhoR  45.69 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  46.92 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  47.47 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  46.7 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  46.92 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  47 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01027  phosphate regulon sensor protein  47.43 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004384  phosphate regulon sensor protein phoR  50.13 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2914  phosphate regulon sensor protein  45.85 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1009  phosphate regulon sensor protein  45.6 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  45.6 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  44.44 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3105  phosphate regulon sensor protein  48.22 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  44.03 
 
 		 438 aa  358  7e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  44.03 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  44.03 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  43.88 
 
 		 446 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4407  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.146321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26034  normal  0.358942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5321  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2231  sensor histidine kinase  40 
 
 		 440 aa  335  9e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0734871  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.825444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  46.61 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5033  PAS:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.44 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  46.05 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70760  two-component sensor PhoR  45.14 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6139  two-component sensor PhoR  45.14 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5478  phosphate regulon sensor protein phoR  43.99 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5607  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 440 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  41.98 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4401  histidine kinase  41.56 
 
 		 447 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 446 aa  310  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  39.41 
 
 		 439 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  39.41 
 
 		 439 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  38.16 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  38.81 
 
 		 443 aa  292  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  39.26 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 437 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  41.55 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  41.55 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  41.55 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  41.55 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 439 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 439 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  41.55 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  40.61 
 
 		 437 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 442 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0823  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 443 aa  285  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.917759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  41.83 
 
 		 436 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 442 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  41.27 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  41.27 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  37.86 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 464 aa  279  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02493  two-component system sensor protein  39.91 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  38.83 
 
 		 430 aa  277  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>