281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1050 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  73.29 
 
 		 278 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  54.84 
 
 		 280 aa  325  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  43.07 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  43.07 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  39.78 
 
 		 280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  42.7 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  42.29 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  42.34 
 
 		 279 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  42.34 
 
 		 279 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  41.97 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  41.97 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  41.97 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  41.97 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  41.97 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  41.24 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  41.24 
 
 		 280 aa  214  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  38.69 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  40.82 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  37.33 
 
 		 273 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  35.56 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  37.44 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  35.56 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  35.11 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  34.53 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  34.22 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  35.68 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  35.24 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  35.27 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  35.02 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  34.29 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  35.02 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  29.28 
 
 		 430 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  29.06 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 		 406 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  29.15 
 
 		 399 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 		 409 aa  99.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  24.77 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  28 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  28.49 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  27.75 
 
 		 410 aa  92.8  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0722  hypothetical protein  26.29 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  25.67 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  21.36 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  25 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  24.75 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  25.48 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  25.81 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  27.59 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2035  hypothetical protein  26.82 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  27.83 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02629  hypothetical protein  21.35 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.15 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  24.19 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  25.11 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  23.75 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  24.27 
 
 		 353 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003755  predicted signal transduction protein  22.08 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.15 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  28.95 
 
 		 724 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  25.88 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1992  putative signal transduction protein  22.44 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.880925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.81 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  26.43 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  22.3 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  24.87 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.81 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  23.61 
 
 		 718 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  22.55 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  27.44 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  24.88 
 
 		 730 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.22 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  29.53 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  26.19 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  25.98 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>