More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1044 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
119 aa  239  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03450  dihydroneopterin aldolase FolB, putative  51.72 
 
 
117 aa  124  4e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  43.1 
 
 
117 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  38.6 
 
 
117 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1802  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1734  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0663  dihydroneopterin aldolase  45.13 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  39.32 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  43.36 
 
 
115 aa  96.7  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  40.71 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0052  putative dihydroneopterin aldolase FolB  39.66 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  43.7 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  37.72 
 
 
121 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0723  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4023  dihydroneopterin aldolase  40 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  42.11 
 
 
117 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  37.93 
 
 
140 aa  92  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  37.72 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4810  dihydroneopterin aldolase  38.26 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.579174  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0423  dihydroneopterin aldolase  38.26 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248997  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  34.75 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0426  dihydroneopterin aldolase  38.26 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285711  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0392  dihydroneopterin aldolase  38.26 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19882  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  36.84 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0828  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 
117 aa  89.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3410  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  40.35 
 
 
117 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0269444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  38.26 
 
 
118 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3569  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  40.35 
 
 
117 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  40.35 
 
 
120 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  37.72 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0558  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  38.46 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.72177e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0639  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  38.46 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00488961  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0298  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  38.46 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00167375  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3562  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  41.23 
 
 
119 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0891124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3466  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  41.23 
 
 
119 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3392  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  41.23 
 
 
119 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000166659  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3460  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  41.23 
 
 
119 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.125867 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3396  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  41.23 
 
 
119 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166332  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  37.72 
 
 
119 aa  87  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3489  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  40.35 
 
 
122 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3236  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  40.35 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02928  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  40.35 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00113929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0641  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  40.35 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000115743  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02878  hypothetical protein  40.35 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000977298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3351  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  40.35 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732659  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1298  dihydroneopterin aldolase  40.37 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0642  dihydroneopterin aldolase  40.35 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0062144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3521  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  40.35 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.316969  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2692  dihydroneopterin aldolase  38.46 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00414447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4370  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  39.47 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516062  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  34.21 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3461  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  39.47 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00080396  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0542  dihydroneopterin aldolase  40.4 
 
 
117 aa  82.8  1e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  31.62 
 
 
121 aa  82.8  2e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4295  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  36.84 
 
 
119 aa  81.6  3e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00183631  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  38.79 
 
 
134 aa  81.6  4e-15  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4636  dihydroneopterin aldolase  38.38 
 
 
117 aa  80.9  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0039  dihydroneopterin aldolase family protein  31.03 
 
 
125 aa  80.5  8e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 
121 aa  79.7  1e-14  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  32.46 
 
 
123 aa  79.7  1e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  38.66 
 
 
135 aa  77.4  5e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1002  dihydroneopterin aldolase  35.96 
 
 
117 aa  77.8  5e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00980814  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 
124 aa  77  7e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  34.21 
 
 
117 aa  76.3  1e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  35.09 
 
 
117 aa  76.3  1e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2011  hypothetical protein  34.21 
 
 
112 aa  76.3  1e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2006  hypothetical protein  34.21 
 
 
112 aa  75.9  2e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07590  dihydroneopterin aldolase  36.84 
 
 
117 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0294524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  32.46 
 
 
117 aa  75.1  3e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  36.97 
 
 
120 aa  75.5  3e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08398e-06 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
116 aa  74.7  4e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 
121 aa  74.7  4e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 
126 aa  74.3  5e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  73.9  6e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  73.9  7e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 
116 aa  73.6  8e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  7.49041e-05 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  73.6  8e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  72.8  1e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0829  dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 
119 aa  73.2  1e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000184652  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 
121 aa  73.2  1e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  73.2  1e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.22875e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
116 aa  72.8  2e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
116 aa  72.8  2e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.33829e-08  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  34.75 
 
 
122 aa  71.6  4e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2676  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate epimerase  31.9 
 
 
116 aa  71.2  4e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.581107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 
130 aa  71.2  4e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2828  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
117 aa  70.9  6e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0032531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.13 
 
 
292 aa  69.7  1e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
122 aa  70.1  1e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  36.52 
 
 
120 aa  68.9  2e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2990  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 
117 aa  69.3  2e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.472635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 
116 aa  68.6  3e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 
116 aa  68.6  3e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>