38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1026 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  39.33 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  32.26 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  32.05 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  29.87 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  30.36 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  31.41 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  31.06 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  30.2 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  26.42 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  28.39 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  26.53 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  29.03 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  28.39 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  26.53 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  26.01 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  25.6 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  62  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  27.74 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  25.97 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  24.86 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  25.32 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  23.18 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  25.43 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  25.43 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  25.81 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  23.53 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  25 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  23.91 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  30.85 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  21.79 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  24.14 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  23.9 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  26.75 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  20.67 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>