95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0966 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 394 aa  817    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  67.27 
 
 		 394 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  61.7 
 
 		 392 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  62.11 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  61.76 
 
 		 392 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  61.95 
 
 		 388 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  60.31 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  60.47 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  56.88 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  57.44 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  45.68 
 
 		 413 aa  359  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  43.58 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  43.48 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  43.45 
 
 		 416 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  43.1 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  43.1 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  40.98 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  40.98 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  40.15 
 
 		 419 aa  315  9e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  41.61 
 
 		 414 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  42.5 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  41.65 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  41.36 
 
 		 414 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  41.16 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  39.25 
 
 		 422 aa  272  7e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  41.58 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  39.31 
 
 		 419 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  38.31 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  39.76 
 
 		 430 aa  246  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  37.72 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.97 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  40.25 
 
 		 421 aa  242  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  36.86 
 
 		 410 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  38.67 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  38.18 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  38.18 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  34.95 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  36.88 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.62 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  35.56 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.08 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  35.47 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  36.52 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  35.56 
 
 		 398 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  36.95 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  36.32 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  35.32 
 
 		 389 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  36.21 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  33.65 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  33.17 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  35.9 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  32.24 
 
 		 502 aa  183  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  33.16 
 
 		 377 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  31.04 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 		 427 aa  149  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  26.41 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  28.25 
 
 		 1506 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  25.61 
 
 		 498 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  30.11 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  25.74 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  30.46 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  31.65 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  31.41 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  38.52 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  29.29 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  30.41 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.86 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  25.5 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  25.25 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  32.52 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  27.86 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  27.03 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  27.22 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  29.79 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  27.15 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  24.87 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  27.6 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  27.14 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  27.41 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  26.05 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  32.45 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  23.57 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  23.57 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  22.54 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  27.57 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  27.15 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  27.46 
 
 		 376 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  27.97 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  27.12 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  27.12 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  24.87 
 
 		 634 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  23.9 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>