144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0945 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0945  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000136612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  34.22 
 
 
254 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  31.84 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.41 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.58 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  31.99 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  33.72 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.71 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  28.04 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  31.97 
 
 
268 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  30.33 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  29.8 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  30.29 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  30.29 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  30.84 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  31.92 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  31.69 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  37.14 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  38.89 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  32.51 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  36.57 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  31.18 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  32.58 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  34.96 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  27.57 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  31.42 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  29.54 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  30 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  30 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.15 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  30.18 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  30 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  32.64 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.52 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  29.59 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  30.27 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  29.88 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  28.8 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  30.5 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  29.73 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  31.91 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  30.45 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  28.74 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  31.84 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  28.74 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  28.86 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  28.69 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  27.17 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  28.74 
 
 
273 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  30.6 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  31.95 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  27.24 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  30.29 
 
 
303 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  31.52 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.56 
 
 
2798 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  31.84 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  32 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  29.1 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  32.31 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.19 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  28 
 
 
269 aa  52  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 
293 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  30.92 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  30.51 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  31.72 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  28.75 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  29.09 
 
 
303 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  26.67 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  33.98 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  31.16 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  29.59 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  31.91 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  27.27 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  27.27 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  28.96 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  25.45 
 
 
246 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  27.03 
 
 
276 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  24.49 
 
 
261 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  25.99 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.73 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  27.92 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  26.18 
 
 
307 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  27.24 
 
 
331 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  25.34 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  32.73 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  25.34 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  27.64 
 
 
273 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  25.41 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  28.52 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  46.43 
 
 
296 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  28.15 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>