217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0941 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 412 aa  854    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  61.27 
 
 		 409 aa  525  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  51.75 
 
 		 449 aa  391  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  50.13 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  50.62 
 
 		 413 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  42.38 
 
 		 392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  42.2 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  45.31 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  32.99 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  32.5 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  33.85 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  31.58 
 
 		 399 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  32.11 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  30.85 
 
 		 602 aa  182  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  31.27 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.2 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  30.03 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  29.02 
 
 		 450 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  32.73 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  30.67 
 
 		 350 aa  166  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  28.79 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  28.83 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  29.66 
 
 		 456 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  28.6 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  29.35 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  30.91 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  28.69 
 
 		 433 aa  159  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  27.99 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  28.88 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  27.87 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  27.72 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  28.4 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  28.12 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  28.32 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  29.07 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  26.9 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  28.19 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  29.04 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  28.61 
 
 		 388 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  29.61 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  27.58 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  28.24 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  27.75 
 
 		 311 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  25.61 
 
 		 328 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  26.1 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  26.9 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  26.9 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  26.24 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  25.07 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  24.87 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  25.43 
 
 		 342 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  25.65 
 
 		 355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  26.36 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  27.03 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  26.92 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.52 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  31.47 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  24.86 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  28.12 
 
 		 354 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  30.56 
 
 		 306 aa  109  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  28.3 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  26.94 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  27.75 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  26.95 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  26.27 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  25.82 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  25.77 
 
 		 352 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  25.21 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  25.45 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  24.87 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  23.84 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  25.07 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  22.54 
 
 		 315 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  24.87 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  27.7 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  22.98 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  26.97 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  26.7 
 
 		 342 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  30.25 
 
 		 307 aa  100  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  22.97 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  27.84 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  27.84 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  22.65 
 
 		 323 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  22.65 
 
 		 323 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  29.57 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  22.65 
 
 		 323 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  22.65 
 
 		 323 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  22.65 
 
 		 323 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  22.73 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  26.32 
 
 		 326 aa  97.4  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  26.03 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  26.98 
 
 		 223 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  22.65 
 
 		 323 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  22.65 
 
 		 323 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  22.91 
 
 		 323 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  22.9 
 
 		 345 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  24.11 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  25.9 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  23.77 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>